呼吸道感染性疾病在臨床上極為常見，病原體的快速檢測和精準診斷是其有效治療的前提。傳統微生物學及免疫學技術對呼吸道病原體的檢測敏感度偏低，核酸檢測技術的發展和臨床應用大幅提升了呼吸道病原體的診斷能力。如何基於患者基礎疾病、呼吸道感染類型及病原譜合理選擇適當的核酸檢測技術並正確理解其臨床應用價值，成為重要的臨床議題。為此，中華檢驗醫學訓練工程專家委員會組織我國多元學科專家共同撰寫了《成人呼吸道感染病原診斷核酸檢測技術臨床應用專家共識（2023）》。
一、基於核酸檢測技術
建議意見1：即時螢光PCR包括單一標靶或多標靶呼吸道病原體核酸檢測，可作為核酸即時檢測法的參考方法，主要適用於門急診、住院病人及大規模人群篩檢。
推薦意見2：等溫擴增耗時短、擴增效率高，通常以核酸即時檢測的形式出現，適用於門急診、發熱診呼吸道感染患者病原體核酸快速篩檢。
建議意見3：數位PCR可直接定量檢測呼吸道檢體中病原體個數，適用於低濃度樣本、低豐度基因或突變基因的檢測，可作其他核酸檢測方法的檢測極限標定。
建議意見4：核酸即時檢測主要適用於檢測場地有限或需要快速篩檢的發燒門診、急診、 ICU等呼吸道感染患者的特定病原體檢測。
推薦意見5：病原體高通量定序在傳統微生物檢驗未能明確病原或急需快速辨別是否感染及其病原體時，選擇性地使用，主要適用於呼吸道重症感染、疑似特殊病原體感染、聚集性呼吸道傳播性感染患者。
二、基於應用場景
1.急性上呼吸道感染高風險族群（老年人、兒童、孕產婦、合併基礎疾病患者等）及氣管支氣管炎患者
推薦意見6：針對此類族群，建議在流感病毒、新型冠狀病毒等流行季節及高風險地區，進行病原體核酸即時檢測，以鑑別診斷、縮短患者就診時間、降低病原體傳播風險。
2.免疫功能正常、有住院風險的氣管支氣管炎成人患者
推薦意見7：針對此類族群，建議採用多標靶病原體核酸檢測技術明確病原，以縮短抗生素使用時間及病人住院時間。
3.社區型肺炎患者
建議意見8：建議重症社區型肺炎患者同時進行常規病原學檢查及核酸檢測，以提高病原體檢出率。
4. 院內獲得性肺炎及呼吸器相關肺炎患者
推薦意見9：病原學診斷應以傳統培養方法為主，必要時聯合採用多標靶病原體核酸檢測，無需常規行mNGS，僅在患者存在免疫缺陷、3d內未通過傳統微生物檢驗明確病原體且經驗性抗感染治療無效時，考慮行以DNA定序為主的mNGS。
5.慢性阻塞性肺病急性惡化患者
建議意見10：不建議常規進行流感病毒、新型冠狀病毒等呼吸道病毒核酸篩檢，僅針對有流行病學史、類流感症狀或病情嚴重需要住院治療的患者進行檢測。
6.結核病患者
建議意見11：建議常規進行結核分枝桿菌塗片、培養及核酸檢測， mNGS與結核特異性PCR對結核菌診斷能力相似。
建議意見12：建議行胸水和胸膜組織的結核分枝桿菌培養和核酸檢測。
8. 可疑活動性結核病患者
建議意見13：對塗片抗酸染色陰性患者，至少進行一次呼吸道檢體的結核分枝桿菌核酸檢測；對塗片抗酸染色陽性患者，核酸擴增技術能鑑定結核分枝桿菌及非結核分枝桿菌。
9. 免疫功能受損合併肺部感染患者
建議意見14：建議同時行血和支氣管肺泡灌洗液標本mNGS，必要時進行組織標本mNGS。
10. 造血幹細胞及實體器官移植後患者
建議意見15：建議定期採用數位PCR方法進行病毒（包括鉅細胞病毒和其他呼吸道病毒）的定量、動態檢測。
文獻來源：徐英春,瞿介明,中華檢驗醫學訓練工程專家委員會等.成人呼吸道感染病原診斷核酸檢測技術臨床應用專家共識（2023）[J/OL].協和醫學雜誌:1-23[2023-08-27].
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